自2019年11月以来，福建各地积极探索政校合作，联合创办河长学院或河湖研究院，为加强河长培训，开展河湖长制课题研究，发挥了较好作用。
1.南平市河湖研究院。2021年7月13日，南平市河长办与武夷学院联合举办“南平市河湖研究院”战略合作框架协议签约暨揭牌仪式，将依托院士专家工作站、科技服务公司等平台，承办河湖讲坛、河长制培训和公益科研活动，为河湖长制提供优质师资等技术支撑。
2.龙岩市河长制研究院。2021年6月3日，龙岩市河长办与闽西职业技术学院联合举办“龙岩市河长制研究院”战略合作框架协议签约暨揭牌仪式。将发挥部门资源及人才优势，打造集人才培训、科学研究、咨询服务和教学实践“四位一体”的河湖治理管护实践平台，通过组建专家库、举办河长讲坛及培训班等方式，持续为龙岩市河湖长制工作输送优质人才。
3.漳州市河长制研究院。2021年3月22日，漳州市河长制办公室与漳州职业技术学院举行“漳州市河长制研究院”战略合作协议签订暨揭牌仪式。该研究院下设办公室、河湖研究中心、河长智库、河长学院、河长制教育示范基地。将在科学研究、研讨培训、人才培养、技术开发、政策与法律咨询、文化宣传等方面，为漳州市全面推行河湖长制提供全方位多渠道的支撑保障。
4.宁德河湖研究院。2021年3月22日，宁德河湖研究院暨河湖健康研究基地揭牌仪式举行，宁德市河长办与福建水利电力职业技术学院签订《共建宁德河湖研究院框架协议》。该研究院将在河湖健康研究、河湖长培训、河湖保护技术开发与合作、河湖管理新措施等方面，为宁德打造幸福河湖献策出力。
5.福州市河湖研究院。2021年2月3日，福州市河长办与福州大学土木工程学院签订战略合作协议，并举行“福州市河湖研究院”揭牌仪式。双方将合力搭建技术服务和人才培养平台，开展河湖健康状况调查、评估和提升等公益科研项目；安排专任教师参与河湖相关理论研究、技术开发、平台应用推广；启动河长制典型案例和先进事例收集整理汇编；组织河长制培训、河湖长讲坛、河长制宣传和科普教育；调动校友资源，依托院士专家工作站、科技服务公司、乡村战略研究院等平台开展社会服务，提升研究院影响力。
6.木兰溪生态河湖研究院。2020年9月28日，莆田市人民政府与河海大学签订战略合作协议，并为“河海大学木兰溪生态河湖研究院”揭牌。双方明确，将深化校地合作，聚焦科学研究、人才培养、河湖长制研究与培训、木兰溪流域治理等方面开展全面合作；建立沟通联络机制，确保有关合作事项落地，助力莆田推动技术创新及特色产业发展，做好水安全、水资源、水经济文章，共建幸福河湖，共同打造提升木兰溪生态文明样本。
7.厦门河长制研究院。2020年8月6日，厦门市河长办与厦门大学公共事务学院联合成立“厦门河长制研究院”，双方将共建厦门河湖长制人才培训和社会实践教育基地，打造河湖治理现代化咨询研究服务平台，开展“美丽河湖”建设行动跨界创新对话交流活动等。
8.三明河湖研究院。2020年6月19日，三明市河长办、永安市政府和福建水利电力职业技术学院，共同举办“三明河湖研究院”签约启动仪式。该研究院将组织和承办河湖讲坛及河长制各个层面培训，邀请国内外知名专家参与河湖讲坛并开设专题讲座，组织师生和相关人员参与活动；发挥高等院校专业优势，进一步深化河长理论研究与探索；调动优势资源，依托院士专家工作站、科技服务公司、乡村战略研究院、福建省环境教育学会等平台，为河湖长制提供师资技术等重要支撑。
9.泉州河长学院。2019年11月26日，泉州市河长办与泉州师范学院签署共建协议，并举行“泉州河长学院”揭牌仪式，该学院将组织全市基层河湖长进行系统轮训，根据不同需求，合理调配师资，科学设置课程，努力打造服务泉州、辐射全省的教学培训平台，课题研究、技术应用的实践基地，成果展示、跨界合作的交流窗口。
